生体分子システム研究班

研究テーマ

■タンパク質間相互作用の解析

我々は、異なるタイプの分子情報を組み合わせることで、タンパク質間相互作用の様々な側面を解析し、その結果に基づいて相互作用パートナーやインタフェースを予測する新たな手法を開発している。


■酵素の構造・機能の解析

酵素の構造や酵素反応機構などを含めた機能を解析・分類する研究を行い、酵素反応データベース・EzCatDBや酵素関連のソフトウェアの開発を行っています。また、酵素だけでなく、酵素と関連した生体分子の解析も行っています。


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Team Member

Hiroyuki Toh 藤 博幸
副研究センター長 E-mail
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藤 博幸
キーワード

タンパク質、アミノ酸配列、塩基配列、立体構造、タンパク質間相互作用、相同性、分子進化

Nozomi Nagano 長野　希美
主任研究員
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E-mail
キーワード

酵素、触媒機構、蛋白質、たんぱく質、タンパク質、立体構造、酵素機能、触媒機能、分類データベース、リガンド、化合物、中間体解析、EzCatDB

論文リスト

  • ■ Nemoto, W. Toh, H.:"Functional region prediction with a set of appropriate homologous sequences - an index for sequence selection by integrating structure and sequence information with spatial statistics" BMC Struct Biol (in press)
  • ■ Daiyasu, H. Hirokawa, T., Kamiya, N., Toh, H.:"Computational Analysis of Ligand Recognition Mechanisms by Prostaglandin E2 (subtype 2) and D2Receptors" Theor. Chem. Acc. 130, 1131-1143 (2011).
  • ■ Kato T, Nagano N: "Discriminative structural approaches for enzyme active-site prediction." BMC Bioinformatics 12, S49, (2011).
  • ■ Kato T, Nagano N:"Metric learning for enzyme active-site search." Bioinformatics. 26(21):2698-2704 (2010).
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