PDB-REPRDB (PDB Rel. #2009_05_08 に基づく)
(最終更新日: 2009年10月28日)

Since 01/Apr/98

タンパク質チェインの選択・整列条件は こちら を御覧下さい。

各々の代表タンパク質チェインは、下記の２つの基準で互いに類似性のないチェインと判断されました。

a ) 配列上の類似性 (ID% =< 閾値１)

ID% : 残基一致率

２つの配列を比較した時、対応する残基間で一致する残基の比率

b ) 立体構造上の類似性 ( Dmax >= 閾値２ )

Dmax : 対応原子間距離の最大値

２つの立体構造を重ね合わせた時、対応する残基のＣα原子間距離の最大値

ID%	チェイン数
	Dmax (A)
	>= 10	>= 30	>= 50	無限
=< 30	17607	10504	9845	9757
=< 50	19984	16338	16016	15950
=< 70	22230	19188	18897	18844
=< 90	26020	23466	23221	23176

この表、および代表チェインは 2009年10月28日 に更新されました。

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ヘルプ

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PDB代表タンパク質チェイン決定システム