PDB-REPRDB
PDB Rel. #2010_05_14 , SCOP Rel. 1.75に基づく, 1746 chains
(2010年12月06日更新)

分類対象チェインの選択・整列

Since 30/Mar/99

ヘルプ

実行の前に「サービス稼働状況」をご確認下さい。

PDB-REPRDBはPDBのタンパク質チェインを配列と構造の両面の類似性によって分類し、各群を座標データの品質が高いチェインで代表させるものです。

項目条件の適用条件優先度

解像度 No Yes X > は排除

R因子 No Yes X > は排除

チェインブレイク数 No Yes X > は排除

非標準残基割合 No Yes X > %は排除

Ｃαのみの残基割合 No Yes X > %は排除

主鎖のみの残基割合 No Yes X > %は排除

配列長 No Yes X < は排除

MUTANTを含む No Yes

COMPLEX COMPLEXのみ
COMPLEXは除く
全て

FRAGMENT FRAGMENTのみ
FRAGMENTは除く
全て

NMRを含む No Yes

［ボタンの説明］
実行=Make List, サービス稼動状況=Service status, 初期化=Reset this form

PDB代表タンパク質チェイン決定システム

項目	条件の適用	条件	優先度
解像度	No Yes	X > は排除
R因子	No Yes	X > は排除
チェインブレイク数	No Yes	X > は排除
非標準残基割合	No Yes	X > %は排除
Ｃαのみの残基割合	No Yes	X > %は排除
主鎖のみの残基割合	No Yes	X > %は排除
配列長	No Yes	X < は排除
MUTANTを含む	No Yes
COMPLEX	COMPLEXのみ COMPLEXは除く全て
FRAGMENT	FRAGMENTのみ FRAGMENTは除く全て
NMRを含む	No Yes

PDB-REPRDB PDB Rel. #2010_05_14 , SCOP Rel. 1.75に基づく, 1746 chains(2010年12月06日 更新)

分類対象チェインの選択・整列

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PDB-REPRDB
PDB Rel. #2010_05_14 , SCOP Rel. 1.75に基づく, 1746 chains
(2010年12月06日更新)

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