今井　賢一郎 Kenichiro Imai - 配列解析チーム -



- 研究テーマ -


　タンパク質は生合成された後、細胞外、細胞膜、細胞小器官等に正確に移送され、そして機能を発揮します。
タンパク質の機能と局在位置は密接な関係にあり、もし、アミノ酸配列からその局在位置を予測することができれば、
機能未知タンパク質の機能の解明に重要な情報となるだけでなく、新薬のターゲットとなりうるタンパク質をゲノム情
報からスクリーニングすることもできます。しかし、タンパク質の局在様式については、未だに解決できていない問題
がたくさんあります。
　タンパク質の局在の問題として、近年主な研究テーマとしているのが、ミトコンドリアタンパク質の輸送です。ミトコン
ドリアはエネルギー産生を行う細胞小器官ですが、アポトーシスといった重要な生命現象とも関係しています。さらに、
ミトコンドリアの機能異常は、癌や心臓病や糖尿病、パーキンソン病などの重大疾患の原因となることが報告されて
います。ミトコンドリアが正常な機能を保つためには、ミトコンドリアに正しくタンパク質が輸送されることが重要です。
ミトコンドリアタンパク質の局在様式の解明はミトコンドリアの働きを知るため、そして、病気の原因解明のために解決
すべき重要な問題となっています。


- 所属 と連絡先 -


  • 産業技術総合研究所　生命情報工学研究センター　配列解析チーム
  • 〒135-0064　東京都江東区青海2-42 産総研　臨海副都心センター別館　9階
  • TEL　03-3599-8062
  • FAX　03-3599-8081
  • e-mail: kenichiroDOTimaiATaistDOTgoDOTjp



    • - これまでのお仕事 -

    発表論文

    1. S. Fu, K. Imai, P.Horton, "Prediction of leucine-rich nuclear export signal containing proteins with NESsential", Nucleic Acids Res, in press, 2011.
    2. K. Imai, N. Fujita, MM. Gromiha, P.Horton, "Eukaryote-wide sequence analysis of mitochondrial β-barrel outer membrane proteins", BMC Genomics, 12, 79 (2011).
    3. K. Imai　and K. Nakai, "Prediction of subcellular locations of proteins: where to proceed?", Proteomics, 10(22), 3970-3983 (2010).
    4. K. Imai, MM. Gromiha, P.Horton, "Mitochondrial beta-barrel proteins, an exclusive club?", Cell, 135(7), 1158-1159 (2008).
    5. K. Imai N. Asakawa, T. Tsuji, F. Akazawa, A. Ino, M. Sonoyama, S. Mitaku, "SOSUI-GramN: high performance prediction for sub-cellular localization of proteins in Gram-negative bacteria.", Bioinformation, 2(9), 417-421, (2008)
    6. 今井賢一郎, 美宅成樹, "古くて新しい問題：タンパク質二次構造ブレイカー", 生物物理,47,49-53 (2007).
    7. K. Imai, M. Sonoyama, S. Mitaku, "A Forth type of Secondary Structure Breaker", Frontiers of Computational Science, 165-170, (2006).
    8. G. D. Ghimire, K. Imai, F. Akazawa, T. Tsuji, M. Sonoyama and S. Mitaku, "Physicochemical properties of amino acid sequences of G-proteins for understanding GPCR-G-protein coupling", CBIJ, 6, 1-16 (2006).
    9. K. Imai, N. Asakawa, T. Tsuji, M.Sonoyama and S. Mitaku, "Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin", CBIJ, 5, 65-77 (2006).
    10. K. Imai, and S. Mitaku, "Mechanisms of secondary structure breakers in soluble proteins", BIOPHYSICS, 1, 55-65 (2005).
    11. K. Imai,　S. Mitaku, "Common Pattern of Coarse-Grained Charge Distribution of Structurally Analogous Proteins", CBIJ. 3, 194-200 (2003).
    12. H. Sakai, M. Michiko, K. Imai, M. Sonoyama, S. Mitaku, "Effect of Carbonic Anhydrase II in Molten Globule State on Physical Properties of Dimyristoyl Phosphatidylcholine Liposome", JJAP. 40, 3521-3525 (2001).
    13. H. Sakai, K. Imai, M. Michiko, M. Sonoyama, S. Mitaku, "Ultrasonic Properties of a Binary System of a Soluble Protein, a-Lactalbumin and Dimyristoyl Phosphatidylcholine Membrane", JJAP. 39, 2948-2949 (2000).

    広報記事

    1. ミトコンドリアのタンパク質に新説
    2. 似ていると思われたミトコンドリアとバクテリアの外膜タンパク質の違いを解明


    SoftWare

    1. グラム陰性菌タンパク質細胞内局在予測システム： SOSUIGramN
    2. タンパク質二次構造ブレイカー予測システム： SOSUIbreaker