今井　賢一郎 Kenichiro Imai - 配列解析チーム -



- 研究テーマ -


　タンパク質は生合成された後、細胞外、細胞膜、細胞小器官等の局在位置に正確に移送され、そして機能を発揮します。タンパク質の機能と局在位置は密接な関係にあり、もし、アミノ酸配列からその局在位置を予測することができれば、機能未知タンパク質のアノテーションに重要な情報を与えるだけでなく、新薬のターゲットとなりうるタンパク質をゲノム情報からスクリーニングすることもできます。
　しかし、タンパク質の局在については、まだまだ解決できていない問題がたくさんあります。そこで、新規の局在シグナルの特定やタンパク質の細胞内局在予測の問題に取り組んでいます。
　最近では、特にミトコンドリアタンパク質の局在問題に力を入れています。ミトコンドリアの異常は、癌や心臓病や糖尿病の原因となっることが報告されており、ミトコンドリアタンパク質の局在様式の解明はミトコンドリアの働きを知る上で重要な問題です。


- 所属 と連絡先 -


  • 産業技術総合研究所　生命情報工学研究センター　配列解析チーム
  • 〒135-0064　東京都江東区青海2-42 産総研　臨海副都心センター別館　9階
  • TEL　03-3599-8062
  • FAX　03-3599-80812
  • e-mail: kenichiroDOTimaiATaistDOTgoDOTjp



    • - これまでのお仕事 -

    発表論文

    1. K. Imai, MM. Gromiha, P.Horton, "Mitochondrial beta-barrel proteins, an exclusive club?", Cell, 135(7), 1158-1159 (2008).
    2. K. Imai N. Asakawa, T. Tsuji, F. Akazawa, A. Ino, M. Sonoyama, S. Mitaku, "SOSUI-GramN: high performance prediction for sub-cellular localization of proteins in Gram-negative bacteria.", Bioinformation, 2(9), 417-421, (2008)
    3. 今井賢一郎, 美宅成樹, "古くて新しい問題：タンパク質二次構造ブレイカー", 生物物理,47,49-53 (2007).
    4. K. Imai, M. Sonoyama, S. Mitaku, "A Forth type of Secondary Structure Breaker", Frontiers of Computational Science, 165-170, (2006).
    5. G. D. Ghimire, K. Imai, F. Akazawa, T. Tsuji, M. Sonoyama and S. Mitaku, "Physicochemical properties of amino acid sequences of G-proteins for understanding GPCR-G-protein coupling", CBIJ, 6, 1-16 (2006).
    6. K. Imai, N. Asakawa, T. Tsuji, M.Sonoyama and S. Mitaku, "Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin", CBIJ, 5, 65-77 (2006).
    7. K. Imai, and S. Mitaku, "Mechanisms of secondary structure breakers in soluble proteins", BIOPHYSICS, 1, 55-65 (2005).
    8. K. Imai,　S. Mitaku, "Common Pattern of Coarse-Grained Charge Distribution of Structurally Analogous Proteins", CBIJ. 3, 194-200 (2003).
    9. H. Sakai, M. Michiko, K. Imai, M. Sonoyama, S. Mitaku, "Effect of Carbonic Anhydrase II in Molten Globule State on Physical Properties of Dimyristoyl Phosphatidylcholine Liposome", JJAP. 40, 3521-3525 (2001).
    10. H. Sakai, K. Imai, M. Michiko, M. Sonoyama, S. Mitaku, "Ultrasonic Properties of a Binary System of a Soluble Protein, a-Lactalbumin and Dimyristoyl Phosphatidylcholine Membrane", JJAP. 39, 2948-2949 (2000).

    広報記事

    1. ミトコンドリアのタンパク質に新説
    2. 似ていると思われたミトコンドリアとバクテリアの外膜タンパク質の違いを解明

    招待講演

    1. 今井賢一郎, "グラム陰性菌のタンパク質細胞内局在予測",第7回生物物理学的アプローチによるゲノム情報解析研究会, 名古屋大学, 2007 12月.
    2. K. Imai, S. Mitaku, "Mechanisms of secondary structure breakers in soluble proteins", International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005, Noyori Conference Hall, Nagoya University, December 12-13, 2005.


    国際会議

    1. K. Imai, S. Mitaku, "Prediction of Secondary Structure Breaker in Soluble Proteins", EABS & BSJ, Okinawa Convention Center, November 12-16, 2006.
    2. K. Imai, S. Mitaku, "Novel Type of Secondary Structure Breaker in Soluble Proteins", 25th Anniversary International CBI Conference (CBI2005), RIKEN Yokohama Institute, August 24-26, 2005.


    SoftWare

    1. グラム陰性菌タンパク質細胞内局在予測システム： SOSUIGramN
    2. タンパク質二次構造ブレイカー予測システム： SOSUIbreaker