TOMINAGA Daisuke

博士（情報工学）
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 分子機能計算チーム
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久留米工業高等専門学校機械工学科から九州工業大学情報工学部、同大大学院情報工学研究科へを経て、2001年博士（情報工学）。大学院在学中からバイオインフォマティクスに携わり、在学中は特に、岡本正宏助教授（現九州大学教授）のもとで非線形数値最適化手法と進化的計算法を使った時系列データからの遺伝子ネットワーク構造の推定法の研究を行う。2001年から現職。現在までにネットワーク構造推定の他に、時系列データを対象とした情報量基準を使った客観的な外れ値除去と平滑化、周期性の判定法、それらを使ったデータ処理システムの開発、S-systemモデルによる動特性解析システムの開発等を行っている。

• 研究分野
  • 遺伝子ネットワークやシグナルパスウェイ等の、生体内反応系の数理モデル
    • 数値最適化によるパラメータ推定
    • 数式処理によるパラメータ記述式導出
    • 数値最適化と数式処理によるパスウェイダイナミクスの解析
  • S-system の動特性解析ツール: sAnalysis
  • 定量的遺伝子発現時系列の解析ツール: くらりねっと
  • 概日周期変動判定システム: ぴっころ
  • フルート演奏
• これまで
  • 1970.11. (S. 45) 福岡県鞍手郡宮田町にて出生
  • 1975.4. (S. 50) 福岡県大野城市御笠幼稚園入園 (1977.3 卒園)
  • 1977.4. (S. 52) 福岡県大野城市立大野北小学校入学 (1979.3 転出)
  • 1979.4. (S. 54) 福岡県太宰府市立太宰府小学校第三学年転入 (1983.3. 卒業)
  • 1983.4. (S. 58) 福岡県太宰府市立太宰府中学校入学 (1986.3. 卒業)
  • 1986.4. (S. 61) 国立久留米工業高等専門学校機械工学科入学 (1991.3. 卒業)
  • 1991.4. (H. 3) 国立九州工業大学情報工学部生物化学システム工学科三年次編入学 (1993.3. 卒業)
  • 1993.4. (H. 5) 国立九州工業大学大学院情報工学研究科博士前期課程入学 (1997.3. 修了)
  • 1997.4. (H. 9) 国立九州工業大学大学院情報工学研究科博士後期課程入学 (2001.3. 修了)
    指導教官: 岡本正宏(1992.4.-2000.9)、柏木浩(2000.9-2001.3)
  • 2001.3. (H. 13) 学位取得 (博士(情報工学)、九州工業大学)
    （以上学歴／以下職歴）
  • 1997.4 (H. 9) 学校法人 麻生塾 麻生電子ビジネス専門学校 非常勤講師 (設計製図コース, -1998.3)
  • 1998.4 (H. 10) 学校法人 麻生塾 麻生工科専門学校 非常勤講師 (-1999.3)
  • 2001.4. (H. 13) 独立行政法人産業技術総合研究所 研究員 (2001年写真, 2002年写真, 2009年写真) (現在に至る)
    • 生命情報科学研究センター 細胞情報科学チーム (高橋勝利リーダー, 2001.4-2003.3)
    • 生命情報科学研究センター 細胞情報チーム (高橋勝利リーダー, チーム改称, 2003.4-2004.3)
    • 生命情報科学研究センター 配列解析チーム (ポール・ホートン リーダー, 2004.4-2006.3) (2005年写真)
    • 生命情報科学研究センター 生体ネットワークチーム (堀本勝久リーダー, 2006.4-2007.3)
    • 生命情報工学研究センター 生体ネットワークチーム (堀本勝久リーダー, センター改称, 2007.4-2010.3)
    • 生命情報工学研究センター 細胞機能設計チーム (藤渕航リーダー, 2010.4-2012.3)
    • 生命情報工学研究センター 分子機能計算チーム (福井一彦リーダー, 2012.4-2012.9)
    • 生命情報工学研究センター 情報基盤統合チーム (福井一彦リーダー, 名称変更, 2012.10-)
  • 2004.7. (H. 16) 国立大学法人熊本大学 大学院 非常勤講師 (-2006.3)
  • 2006.4. (H. 18) 文部科学省科学技術振興調整費新興分野人材養成事業 生命情報科学技術者養成コース 講師 (-2010.3)
  • 2008.4. (H. 20) 国立大学法人東京医科歯科大学 大学院 非常勤講師 (-2012.3)
  • 2009.4. (H. 21) 学校法人早稲田大学 ITバイオ研究所 (2010年4月から ITバイオ・マイニング研究所) 客員研究員 (現在に至る)
  • 2009.11. (H. 21) 学校法人早稲田大学 理工学術院 客員准教授 (現在に至る)
  • 2010.4 (H. 22) 生命情報科学人材養成コンソーシアム講師 (-2012.3)
  • 2011.10. (H. 23) 国立大学法人東京大学 大学院新領域創成科学研究科 非常勤講師 (現在に至る)
  • 2012.4. (H. 24) 学校法人明治薬科大学 非常勤講師 (現在に至る)
  • 2012.4. (H. 24) HPCI戦略プログラムにおける人材養成プログラム講師 (現在に至る)
• 資格
  • 1990.8. (H2.8) 第一種普通自動車運転免許
  • 1993.7. (H5.7) 第二種情報処理技術者試験合格
  • 1996.7. (H8.7) 第一種情報処理技術者試験合格
• 講義資料
• 就職活動用プレゼン 平成１７年４月現在
• これまでの研究の概要 HTML PDF iWork
• 業績リスト (Nov., 2010) リッチテキスト PDF iWork
• 円筒計算尺を作ろう (簡単編 | 多機能編 | 高精度編 | 怒濤の歴史 | 便利な使い方 | 私の研究と計算尺)
• 普通の計算尺を作ろう / (作り方 / 使い方 / 使い方PDF版)
• 翻訳した文章
• 研究上、やむを得ず得たIT関連Tips
• 研究上、やむを得ず得たIT関連でないTips
• 勤務地周辺の環境と鳥
• 他人の講義資料